ABSTRACT
Abstract: The Orinoco Goose (Neochen jubata) is a few-known and endemic Anatidae to South America, inhabiting sandy beaches along medium and large rivers, with a well-developed riparian forest and in swamp savannas and large freshwater baths. Recent data indicate the presence of longitudinal migratory behavior, and despite them, there are no records on the genetic profile of this species. The Araguaia River region, in the municipality of Luiz Alves, Goiás, receives an undetermined number of ducks seasonally, and there is little information about the individuals who visit this place, constituting the ideal scenario for a study able to offer a genetic overview perspective of this species and to understand the relationship between these individuals better. For this, we genetically characterized 61 individuals sampled in three distinct years of collection using microsatellite molecular markers and mitochondrial DNA. Genetic diversity analyses revealed low levels of heterozygosity for all sampled groups. However, they are within the equilibrium proposed by Hardy-Weinberg (HWE), as inbreeding or drift are not acting in these groups. The parentage analysis supports it, showing a high number of unrelated individuals over the years. AMOVA showed a significant difference among groups. These results may reflect the structure of this migratory species in that region, with the paired differentiation test of individuals from 2013 and 2014 being more similar to each other than those from other years, indicating a possible genetic structure diagnosed by the years of capture. However, there is a high allelic sharing among the three sampled groups, suggesting that these individuals are a population that connects over time and that they have a philopatric relationship with the location. The results found in this study constitute an initial milestone for the genetic knowledge of the mallard duck that should be raised in many other genetic studies.
Resumo: O ganso-do-orinoco (Neochen jubata) é um anatídeo endêmico da América do Sul, cujo habitat são praias arenosas ao longo de rios médios e grandes, com uma vegetação ripária bem desenvolvida e em savanas do pântano com extensos banhados de água doce. Dados recentes indicam a presença de comportamento migratório longitudinal e, apesar destes, não existem registros sobre o perfil genético dessa espécie. A região do rio Araguaia, no município de Luiz Alves, Goiás, recebe um número indeterminado de patos sazonalmente e há poucas informações sobre os indivíduos que visitam este local, constituindo o cenário ideal para um estudo capaz de oferecer uma perspectiva genética geral dessa espécie e também de entender melhor a relação de parentesco entre esses indivíduos. Para tal, caracterizamos geneticamente 60 indivíduos amostrados em três anos distintos de coleta, utilizando marcadores moleculares microssatélites e DNA mitocondrial. As análises de diversidade genética revelaram baixos níveis de heterozigosidade para todos os grupos amostrados. No entanto, eles estão dentro do Equilíbrio proposto por Hardy-Weinberg (HWE), pois a consanguinidade ou a deriva não estão atuando nesses grupos, a análise de parentesco apoia este resultado indicando um alto número de indivíduos não relacionados ao longo dos anos. A AMOVA apresentou diferença significativa entre os grupos. Esses resultados podem refletir a estrutura dessa espécie migratória naquela região, com o teste de diferenciação pareada de indivíduos de 2013 e 2014 sendo mais semelhantes entre si do que os de outros anos, indicando uma possível estruturação genética diagnosticada pelos anos de captura. No entanto, há um alto compartilhamento alélico entre os três grupos amostrados sugerindo que esses indivíduos são uma população que se conecta ao longo do tempo e que têm uma relação filopátrica com o local. Os resultados aqui encontrados constituem um marco inicial para o conhecimento genético do ganso-do-orinoco que contribuirá para novos estudos sobre esta espécie considerada "quase ameaçada" pela IUCN.
ABSTRACT
Abstract Background: Romosinuano cattle breed in Mexico has endured isolation and it is necessary to characterize it in order to facilitate sustainable genetic management. Objective: To assess the evolution of the structure and genetic diversity of the Romosinuano breed in Mexico, through pedigree analysis. Methods: Pedigree data was obtained from Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). The ENDOG program (4.8 version) was used to analyze two datasets, one that includes upgrading from F1 animals (UP) and the other with only straight-bred cattle (SP). For both datasets, three reference populations were defined: 1998-2003 (RP1), 2004-2009 (RP2), and 2010-2017 (RP3). The pedigree included 3,432 animals in UP and 1,518 in SP. Demographic parameters were: Generation interval (GI), equivalent number of generations (EG), pedigree completeness index (PCI), and gene flow among herds. Genetic parameters were: Inbreeding (F) and average relatedness (AR) coefficients, effective population size (Nec), effective number of founders and ancestors, and number of founder genome equivalents. Results: The GI varied from 6.10 to 6.54 for UP, and from 6.47 to 7.16 yr for SP. The EG of the UP and SP improved >63% from RP1 to RP3. The PCI increased over time. No nucleus or isolated herds were found. For RP3, F and AR reached 2.08 and 5.12% in the UP, and 2.55 and 5.94% in the SP. For RP3, Nec was 57 in the UP and 45 in the SP. Genetic diversity losses were attributed mainly (>66%) to genetic drift, except for RP3 in the SP (44%). Conclusions: A reduction of the genetic diversity has been occurring after the Romosinuano breed association was established in Mexico, and this is mainly due to random loss of genes.
Resumen Antecedentes: La raza bovina Romosinuano ha estado prácticamente aislada en México y requiere ser caracterizada para un manejo genético sostenible. Objetivo: Evaluar la evolución de la estructura y diversidad genética de la raza Romosinuano en México, mediante el análisis del pedigrí. Métodos: Los datos genealógicos provinieron de la Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). Los análisis se realizaron con el programa ENDOG (versión 4.8) para dos bases de datos, una que incluyó animales en cruzamiento absorbente (UP) a partir de F1 y la otra con sólo animales puros (SP). Para ambas bases de datos se definieron tres poblaciones de referencia: 1998-2003 (RP1), 2004- 2009 (RP2), y 2010-2017 (RP3). El pedigrí incluyó 3.432 animales en la UP y 1.518 en la SP. Los parámetros demográficos fueron: intervalo generacional (GI), número de generaciones equivalentes (EG), índice de completitud del pedigrí (PCI), y flujo de genes entre hatos. Los parámetros genéticos fueron: coeficientes de consanguinidad (F) y de relación genética aditiva (AR), tamaño efectivo de la población (Nec), número efectivo de fundadores y ancestros, y número equivalente de genomas fundadores. Resultados: El GI varió de 6,10 a 6,54 para la UP, y de 6,47 a 7,16 años para la SP. El EG de la UP y la SP mejoró >63%, de RP1 a RP3. El PCI aumentó a través de los años, pero más para la SP que para la UP. No se encontraron hatos núcleo o aislados. Para RP3, F y AR alcanzaron 2,08 y 5,12% en la UP, y 2,55 y 5,94% en la SP. Para RP3, Nec fue 57 en la UP y 45 en la SP. Más de 66% de las pérdidas en diversidad genética se debieron a deriva genética, excepto para RP3 en la UP (44%). Conclusiones: una reducción de la diversidad genética ha estado ocurriendo después de que se formó la asociación de criadores de ganado Romosinuano en México, y es debida principalmente a pérdidas aleatorias de genes.
Resumo Antecedentes: A raça bovina Romosinuano tem estado praticamente isolada no México e precisa ser caracterizada para um manejo genético sustentável. Objetivo: Avaliar a evolução da estrutura e diversidade genética da raça Romosinuano no México, através da análise de pedigree. Métodos: Os dados genealógicos vieram da Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). As análises foram feitas com o programa ENDOG (versão 4.8) para duas bases de dados, uma que incluiu animais em cruzamento absorvente (UP) a partir da F1 e a outra base de dados somente com animais puros (SP). Para ambas bases de dados foram definidas três populações de referência: 1998-2003 (RP1), 2004-2009 (RP2) e 2010-2017 (RP3). O pedigree incluiu 3.432 animais na UP e 1.518 na SP. Os parâmetros demográficos foram: intervalo entre gerações (GI), número de gerações equivalentes (EG), índice de completude do pedigree (PCI), e fluxo de genes entre rebanhos. Os parâmetros genéticos foram: coeficiente de consanguinidade (F) e da relação genética aditiva (AR), tamanho efetivo da população (Nec), número efetivo de fundadores e ancestrais, e número equivalente de genomas fundadores. Resultados: O GI variou de 6,10 a 6,54 para a UP, e de 6,47 a 7,16 anos para a SP. EG da UP e a SP melhorou >63%, de RP1 a RP3. O PCI aumentou ao longo dos anos, mas mais para a SP do que para o UP. Não se encontraram rebanhos núcleo ou isolados. Para RP3, F e AR alcançaram 2,08 e 5,12% na UP, e 2,55 e 5,94% na SP. Para RP3, Nec foi 57 na UP e 45 na SP. Mais de 66% das perdas em diversidade genética foram ocasionadas pela deriva genética, exceto para RP3 no UP (44%). Conclusões: Depois que a associação da raça Romosinuano foi estabelecida no México, tem ocorrido uma redução da diversidade genética, principalmente devido a perdas aleatórias de genes.
ABSTRACT
Abstract Brazilian laws allow the catch of some species as ornamental fish; however, in the absence of biological information, such catch can threaten species conservation. Therefore, this study aimed to offer population and reproductive information about Farlowella hahni in streams of the Ivinhema River Basin, Upper Paraná Basin. To accomplish this, a total of 165 F. hahni individuals were analyzed, including 109 females and 48 males, resulting in an important sex ratio difference from 1:1 (χ 2=19.97; p<0.001), indicating a predominance of females throughout the year. Females reach higher standard length than males. Males presented isometric Length-Weight Relationships, while females have positive allometric growth. Gonadosomatic index presented higher values from October through December. The mean fecundity was 100.3±36.4 of vitellogenic oocytes and was positively correlated with standard length (r=0.51; p=0.01). The data presented herein are the first for this species and suggest a need to carefully manage the F. hahni population, considering its low abundance and fecundity.
Resumo As leis brasileiras permitem a captura de algumas espécies de peixes como ornamentais, no entanto, a ausência de informações biológicas pode tornar esta captura uma ameaça para a conservação destas espécies. Este estudo teve como objetivo oferecer informações populacionais e reprodutivas sobre Farlowella hahni em riachos da Bacia do rio Ivinhema, bacia do Alto Paraná. Um total de 165 indivíduos de F. hahni foi analisado, sendo 109 fêmeas e 48 machos. A proporção de sexo foi diferente de 1:1 (χ2=19,97; p<0,001), com predominância de fêmeas ao longo do ano. As fêmeas atingiram maior comprimento padrão do que os machos. Os machos apresentaram crescimento isométrico e as fêmeas crescimento alométrico positivo. O índice gonadossomático apresentou maiores valores de Outubro a Dezembro. A fecundidade média foi de 100,3±36,4 de ovócitos vitelogênicos e foi correlacionada positivamente com o comprimento padrão (r=0,51; p=0,01). Os dados apresentados são os primeiros para essa espécie e sugerem a necessidade de cuidados no manejo da população de F. hahni considerando baixa abundância e fecundidade.
Subject(s)
Animals , Male , Female , Catfishes/physiology , Life History Traits , Brazil , RiversABSTRACT
Abstract Analysis of abundance and population structure of Plesionika narval was performed on data concerning 5,255 specimens obtained from 62 fishing sets carried out off the Madeira archipelago (Northeastern Atlantic) between 2004 and 2008 in a depth range from 101 to 350 m. Abundance ranged from 0.01 to 19.74 specimens-per-trap and significant differences were found between seasons, probably as a result of an increment of population in the spring during the recruitment season. The analysis of size distribution revealed that the carapace length (CL) ranged from 2.45 to 28.61 mm and that mean female size consistently exceeded that of males. Differences in mean CL were statistically significant between depth strata and seasons. Of the specimens sampled, 57.00% were males, 41.88% females and 1.42% undetermined. Sex ratio also differed significantly between seasons according to depth strata, consolidating the hypothesis of the existence of seasonal migrations related with the reproductive cycle of this species. Ovigerous females showed larger sizes and occurred all year around and remain in shallow waters in winter, summer and autumn and move to deeper waters in spring. The highest frequency of ovigerous females was recorded in summer, between 151 and 200 m deep supporting the hypothesis that spawning of this species occurs in shallow waters, especially in late summer.
Resumo O estudo de abundância e dinâmica populacional de Plesionika narval foi efetuado com 5.255 espécimes provenientes de 62 lances de pesca realizados ao largo do arquipélago da Madeira (Atlântico Nordeste) de 2004 a 2008 entre 101 e 350 m de profundidade. A abundância oscilou entre 0,01 e 19,74 espécimes-por-armadilha com diferenças significativas entre estações provavelmente devido ao aumento da população na primavera durante o período de recrutamento. A análise da distribuição de tamanhos revelou que o comprimento da carapaça (CL) variou entre 2,45 e 28,61 mm e que o tamanho médio das fêmeas excedeu o dos machos. Verificaram-se diferenças significativas no CL médio entre estrato de profundidade e estação. Do total amostrado, 57,00% foram machos, 41,88% fêmeas e 1,42% indeterminados. A razão de sexos também diferiu significativamente entre estações de acordo com a profundidade, consolidando a hipótese da existência de migrações sazonais relacionadas com o ciclo reprodutivo desta espécie. As fêmeas ovadas apresentaram maiores tamanhos e ocorreram durante todo o ano permanecendo em águas pouco profundas no inverno, verão e outono e migrando para águas profundas na primavera. A maior frequência de fêmeas ovadas foi registada no verão, entre 151 e 200 m de profundidade reforçando a hipótese de que a desova desta espécie ocorre em águas menos profundas, especialmente no final do verão.
Subject(s)
Animals , Male , Female , Pandalidae/physiology , Animal Distribution , Portugal , Reproduction , Seasons , Sex Ratio , Atlantic Ocean , Population Dynamics , Body SizeABSTRACT
ABSTRACT: Understanding genetic variability in existing wheat accessions is critical for collection, conservation and use of wheat germplasms. In this study, 138 Chinese southwest wheat accessions were investigated by genotyping using two resistance gene makers (Pm21 and Yr26) and DArT-seq technique. Finally, about 50% cultivars (lines) amplified the specific allele for the Yr26 gene (Gwm11) and 40.6% for the Pm21 gene (SCAR1265). By DArT-seq analysis, 30,485 markers (6486 SNPs and 23999 DArTs) were obtained with mean polymorphic information content (PIC) value 0.33 and 0.28 for DArT and SNP marker, respectively. The mean Dice genetic similarity coefficient (GS) was 0.72. Two consistent groups of wheat varieties were identified using principal coordinate analysis (PCoA) at the level of both the chromosome 6AS and the whole-genome, respectively. Group I was composed of non-6VS/6AL translocation lines of different origins, while Group II was composed of 6VS/6AL translocation (T6VS/6AL) lines, most of which carried the Yr26 and Pm21 genes and originated from Guizhou. Besides, a model-based population structure analysis revealed extensive admixture and further divided these wheat accessions into six subgroups (SG1, SG2, SG3, SG4, SG5 and SG6), based on their origin, pedigree or disease resistance. This information is useful for wheat breeding in southwestern China and association mapping for disease resistance using these wheat germplasms in future.
RESUMO: O conhecimento da estrutura da população é essencial para o mapeamento de associação de resistência a doenças para a população de trigo. Neste estudo, a técnica de DART-seq™ foi usada para genotipar o genoma inteiro de cultivares de trigo. Finalmente, 30,485 marcadores (6486 SNPs e 23999 dardos) foram obtidos, e dois grupos de variedades de trigo foram identificados por meio de análise principal-coordenadas (PCoA) do nível de todo o genoma e o nível 6AS cromossomo. O grupo I foi composto por linhas não T6VS/6Al de diferentes origens, enquanto o Grupo II foi composto de linhas T6VS/6Al, sendo que da maioria destes realizados os genes Yr26 e PM21 originários de Guizhou.
ABSTRACT
Abstract Background: indigenous breeds are important for poor farmers because of their natural selection against harsh environments and adaptation to regional conditions. However, inbreeding of indigenous sheep populations has increased in Colombia due to indiscriminate cross-breeding with foreign animals and lack of reproductive controls, with subsequent loss in productivity, which poses a great risk for the conservation of valuable genes. Objective: to determine the genetic diversity in Colombian indigenous sheep by using a panel of 10 microsatellite molecular markers. Methods: blood samples from 362 individuals from 43 farms in 11 Colombian provinces were genotyped and analyzed for a panel of 10 microsatellite markers. Results: a total of 134 alleles were found (13.4 alleles/locus on average) with a range of observed and expected heterozygosity of 0.428 to 0.831 and 0.615 to 0.855, respectively, and 0.742 polymorphic information content (PIC). The average Wright F-statistics (FIS ) of the breeds was 0.107, suggesting moderate levels of inbreeding. Colombian sheep showed a low level of genetic differentiation among breeds (FST = 0.054) and STRUCTURE analysis showed complex patterns of admixture in the breeds. Conclusion: overall, Colombian sheep have high genetic variability, which is very important for future conservation programs and genetic improvement.
Resumen Antecedentes: las razas animales autóctonas son importantes para los agricultores de escasos recursos a causa de su selección natural contra el duro ambiente y su adaptación a condiciones regionales. Sin embargo en Colombia, debido al cruce indiscriminado con razas foráneas y a la falta de control de la reproducción, ha aumentado la consanguinidad en las poblaciones de ovinos criollos y por lo tanto la pérdida en la productividad, lo que supone un gran riesgo para la conservación de genes valiosos. Objetivo: determinar la diversidad genética en razas criollas de ovinos colombianos utilizando análisis por microsatélites. Métodos: se visitaron 43 granjas localizadas en 11 departamentos del país, en las cuales se tomaron muestras de sangre a 362 individuos. Las muestras fueron genotipadas y analizadas para un panel de 10 marcadores microsatélites. Resultados: un total de 134 alelos fueron encontrados (13,4 alelos/locus en promedio), con un rango de heterocigocidad observada y esperada de 0,428 a 0,831 y 0,615 a 0,855, respectivamente, y un contenido de información polimórfica (PIC) promedio de 0,742. El Wright F-statistics (FIS) promedio de las razas evaluadas fue 0,107, lo cual sugiere que las razas tienen niveles moderados de consanguinidad. Las ovejas colombianas presentaron un bajo grado de diferenciación genética entre las distintas razas (FST = 0,054) y el análisis de STRUCTURE mostró complejos patrones de mezcla en las razas estudiadas. Conclusión: en términos generales, las ovejas colombianas presentan una alta variabilidad genética lo cual es muy importante para futuros programas de conservación y mejoramiento genético.
Resumo Antecedentes: as raças crioulas, devido a sua seleção natural em ambientes hostis e adaptação às condições regionais, são importantes para os agricultores de poucos recursos econômicos. Porém, na Colômbia, devido ao cruzamento indiscriminado com raças estrangeiras e a falta de controle na reprodução, tem aumentado a consanguinidade nas populações de ovinos crioulos e por tanto tem gerado perda na produtividade, o que faz supor um grande risco para a conservação de genes valiosos. Objetivo: determinar a diversidade genética em raças crioulas colombianas utilizando um painel de 10 marcadores moleculares microssatélites. Métodos: visitaram-se 43 granjas localizadas em 11 departamentos do país, nos quais foram amostrados 362 indivíduos, que foram genotipados e analisados para um painel de 10 marcadores microssatélites. Resultados: um total de 134 alelos foram encontrados (média de 13,4 alelos/locus), com um rango de heterocigocidade observada e esperada de 0,428 a 0,831 e 0,615 a 0,855, respectivamente, e um conteúdo de informação polimórfica (PIC) médio de 0,742. O Wright F-statistics (FIS) médio das raças avaliadas foi de 0,107, o qual sugere que as raças apresentam níveis moderados de consanguinidade. As ovelhas colombianas apresentaram um baixo grau de diferenciação genética entre as diferentes raças (FST = 0,054) e o análise de STRUCTURE mostrou complexos patrões de mistura nas raças estudadas. Conclusão: em termos gerais, as ovelhas colombianas apresentaram uma alta variabilidade genética, o qual é muito importante para futuros programas de conservação e melhoramento genético.
ABSTRACT
Abstract Analysis of abundance and population structure of Plesionika narval was performed on data concerning 5,255 specimens obtained from 62 fishing sets carried out off the Madeira archipelago (Northeastern Atlantic) between 2004 and 2008 in a depth range from 101 to 350 m. Abundance ranged from 0.01 to 19.74 specimens-per-trap and significant differences were found between seasons, probably as a result of an increment of population in the spring during the recruitment season. The analysis of size distribution revealed that the carapace length (CL) ranged from 2.45 to 28.61 mm and that mean female size consistently exceeded that of males. Differences in mean CL were statistically significant between depth strata and seasons. Of the specimens sampled, 57.00% were males, 41.88% females and 1.42% undetermined. Sex ratio also differed significantly between seasons according to depth strata, consolidating the hypothesis of the existence of seasonal migrations related with the reproductive cycle of this species. Ovigerous females showed larger sizes and occurred all year around and remain in shallow waters in winter, summer and autumn and move to deeper waters in spring. The highest frequency of ovigerous females was recorded in summer, between 151 and 200 m deep supporting the hypothesis that spawning of this species occurs in shallow waters, especially in late summer.
Resumo O estudo de abundância e dinâmica populacional de Plesionika narval foi efetuado com 5.255 espécimes provenientes de 62 lances de pesca realizados ao largo do arquipélago da Madeira (Atlântico Nordeste) de 2004 a 2008 entre 101 e 350 m de profundidade. A abundância oscilou entre 0,01 e 19,74 espécimes-por-armadilha com diferenças significativas entre estações provavelmente devido ao aumento da população na primavera durante o período de recrutamento. A análise da distribuição de tamanhos revelou que o comprimento da carapaça (CL) variou entre 2,45 e 28,61 mm e que o tamanho médio das fêmeas excedeu o dos machos. Verificaram-se diferenças significativas no CL médio entre estrato de profundidade e estação. Do total amostrado, 57,00% foram machos, 41,88% fêmeas e 1,42% indeterminados. A razão de sexos também diferiu significativamente entre estações de acordo com a profundidade, consolidando a hipótese da existência de migrações sazonais relacionadas com o ciclo reprodutivo desta espécie. As fêmeas ovadas apresentaram maiores tamanhos e ocorreram durante todo o ano permanecendo em águas pouco profundas no inverno, verão e outono e migrando para águas profundas na primavera. A maior frequência de fêmeas ovadas foi registada no verão, entre 151 e 200 m de profundidade reforçando a hipótese de que a desova desta espécie ocorre em águas menos profundas, especialmente no final do verão.
ABSTRACT
Abstract Brazilian laws allow the catch of some species as ornamental fish; however, in the absence of biological information, such catch can threaten species conservation. Therefore, this study aimed to offer population and reproductive information about Farlowella hahni in streams of the Ivinhema River Basin, Upper Paraná Basin. To accomplish this, a total of 165 F. hahni individuals were analyzed, including 109 females and 48 males, resulting in an important sex ratio difference from 1:1 ( 2=19.97; p 0.001), indicating a predominance of females throughout the year. Females reach higher standard length than males. Males presented isometric Length-Weight Relationships, while females have positive allometric growth. Gonadosomatic index presented higher values from October through December. The mean fecundity was 100.3±36.4 of vitellogenic oocytes and was positively correlated with standard length (r=0.51; p=0.01). The data presented herein are the first for this species and suggest a need to carefully manage the F. hahni population, considering its low abundance and fecundity.
Resumo As leis brasileiras permitem a captura de algumas espécies de peixes como ornamentais, no entanto, a ausência de informações biológicas pode tornar esta captura uma ameaça para a conservação destas espécies. Este estudo teve como objetivo oferecer informações populacionais e reprodutivas sobre Farlowella hahni em riachos da Bacia do rio Ivinhema, bacia do Alto Paraná. Um total de 165 indivíduos de F. hahni foi analisado, sendo 109 fêmeas e 48 machos. A proporção de sexo foi diferente de 1:1 (2=19,97; p 0,001), com predominância de fêmeas ao longo do ano. As fêmeas atingiram maior comprimento padrão do que os machos. Os machos apresentaram crescimento isométrico e as fêmeas crescimento alométrico positivo. O índice gonadossomático apresentou maiores valores de Outubro a Dezembro. A fecundidade média foi de 100,3±36,4 de ovócitos vitelogênicos e foi correlacionada positivamente com o comprimento padrão (r=0,51; p=0,01). Os dados apresentados são os primeiros para essa espécie e sugerem a necessidade de cuidados no manejo da população de F. hahni considerando baixa abundância e fecundidade.
ABSTRACT
Abstract The introduction of a species may alter ecological processes of native populations, such as pollination and dispersal patterns, leading to changes in population structure. When the introduced and the native species are congeners, interference in pollination can also lead to hybridization. We aimed to understand the ecological aspects of Euterpe oleracea introduction in the Atlantic forest and the possible consequences for the conservation of the native congener Euterpe edulis. We analysed the population structure of palm populations, including hybrids, and observed the interaction with frugivorous birds of both palm species after E. oleracea introduction. We observed that E. edulis had significantly lower density and a smaller number of seedlings when occurring with E. oleracea. Native and introduced Euterpe species shared nine frugivorous bird species. E. oleracea and hybrids had dispersed outside the original planting area. Consequently, the risks of introduction of E. oleracea may mostly be related to the disruption of interactions between E. edulis and frugivorous birds and the spontaneous production of hybrids. Finally, the cultivation of E. oleracea and hybrids in Atlantic rainforest could affect the conservation of the already endangered E. edulis.
Resumo A introdução de uma espécie pode alterar processos ecológicos de populações nativas, tais como padrões de polinização e dispersão, levando a mudanças na estrutura populacional. Quando espécies introduzidas e nativas são congêneres, a interferência na polinização pode levar também à hibridização. Nossos objetivos foram entender os aspectos ecológicos da introdução de Euterpe oleracea na Floresta Atlântica e as possíveis consequências sobre a conservação da congênere nativa Euterpe edulis. Para isso, analisamos a estrutura populacional, incluindo híbridos, e observamos a interação de aves frugívoras com ambas as espécies de palmeira após a introdução de E. oleracea. Observamos que E. edulis apresentou densidade total e número de plântulas menores quando coocorrente com E. oleracea. As palmeiras congenéricas compartilharam nove espécies de aves frugívoras. E. oleracea e híbridos foram dispersos além da área original de plantio. Consequentemente, os riscos da introdução de E. oleracea podem estar principalmente relacionados com o possível deslocamento de interações entre E. edulis e aves frugívoras e com a produção de híbridos. Desta forma, o cultivo de E. oleracea e híbridos podem afetar a conservação da já ameaçada E. edulis.
Subject(s)
Euterpe/physiology , Food Chain , Hybridization, Genetic , Plant Dispersal , Brazil , Conservation of Natural Resources , Euterpe/genetics , Euterpe/growth & development , Introduced Species , Population Dynamics , Rainforest , Species SpecificityABSTRACT
Abstract Green lacewings are insects with great potential to be use in the biological control of agricultural pests, but relatively few studies have attempted to understand the genetic structure of these agents, especially those of predatory insects. The purpose of this study was to characterize genetically populations of C. externa using sequences of subunit I of the cytochrome oxidase, a mitochondrial gene, and examine the population structure of this species in sampled areas in São Paulo state. The results indicate high genetic diversity but no genetic structure, detected by AMOVA analysis, and high levels of haplotype sharing in the network. These genetic patterns could be a consequence of environmental homogeneity provided by agroecosystem (citrus orchard), allowing gene flow among populations. Probably there is a unique population in the area sampled that could be used as a population (genetic) source for mass-reared and posterior release in these farms.
Resumo Crisopídeos são insetos com grande potencial para uso em controle biológico de pragas agrícolas, mas relativamente poucos estudos têm tentado compreender a estrutura genética destes agentes, especialmente no caso de insetos predadores. O objetivo deste trabalho foi caracterizar geneticamente populações de C. externa utilizando sequências da subunidade I do gene mitocondrial citocromo oxidase e avaliar a estruturação populacional desta espécie em áreas amostras no estado de São Paulo. Os resultados indicaram elevada diversidade genética e nenhuma estruturação genética, detectada pela AMOVA, além de elevado compartilhamento na rede haplotípica. Este padrão genético poderia ser uma consequência da homogeneidade ambiental favorecida pelos agroecossistemas (citricultura), permitindo fluxo gênico entre as populações. Provavelmente há uma única população, do ponto de vista genético, na área amostrada que poderia ser utilizada em criações massais e em liberações nas fazendas desta região.
Subject(s)
Animals , Genetic Variation , Insecta/genetics , Pest Control, Biological , Electron Transport Complex IV/genetics , Haplotypes , Insect Proteins/genetics , Mitochondrial Proteins , Sequence Analysis, DNAABSTRACT
The mangrove crab (Ucides cordatus) is a valuable fishery resource, overfished along the Brazilian coast. This study aimed to obtain bioecological data on this crab along the coast of the State of Amapá. Six bimonthly samplings were conducted between December 2008 and January 2010. Transects were used to estimate the density (burrows m-2) and population abundance (individuals m-2). All the animals were subjected to biometrics, with females being classified according to their stage of gonadal maturation. The mean density (1.09 burrows m-2) and abundance (0.31 individuals m-2) were influenced by the climate with the highest values in summer (1.17 burrows m-2 and 0.34 individuals m-2). The male to female ratio was 1.38:1 showing significant difference in the proportion of sexes. The individuals showed sexual dimorphism, with linear measurements significantly higher in males. The sampled animals also had larger carapace length and width (CL and CW) compared to crabs studied in other Brazilian states. There was a positive relationship between CW and CL and individual weight (IW) and CW for males (R² = 0.83 and 0.90) and females (R² = 0.79 and 0.84). The growth was negative allometric (CL increases to a lesser extent than CW) for both sexes. The highest frequency of ovigerous females (78%) and in maturation stage IV (38%) occurred in the CW size class between 59.8 and 67.5 mm. The peak of mature females occurred in May and August, showing a reproductive period different from those in other Brazilian states.
O caranguejo-uçá (Ucides cordatus) é um valioso recurso pesqueiro, sobreexplorado ao longo do litoral brasileiro. O objetivo deste trabalho foi obter dados bioecológicos deste caranguejo em toda a costa do Estado do Amapá. Foram realizadas seis coletas de frequência bimensal, compreendidas entre os meses de dezembro de 2008 a janeiro de 2010. Por meio de transectos foram estimadas a densidade (tocas m-2) e a abundância (indivíduos m-2) populacional. Todos os animais foram submetidos à biometria, sendo somente as fêmeas, classificadas quanto ao estágio de maturação gonadal. A densidade (1,09 tocas m-2) e a abundância (0,31 indivíduos m-2) foram influenciadas pelo clima, sendo os maiores valores observados durante o verão (1,17 tocas m-2 e 0,34 indivíduos m-2). A razão sexual foi de 1,38M:1F, mostrando diferença significativa entre a proporção de sexos. Os indivíduos apresentaram dimorfometria sexual, com medidas lineares significativamente superiores nos machos. Os animais coletados também apresentaram maior comprimento e largura de cefalotórax (CC e LC), quando comparados aos caranguejos estudados em outros estados brasileiros. Houve relação tanto entre LC e CC, como entre peso individual (PI) e LC para machos (R² = 0,83 e 0,90) e fêmeas (R² = 0,79 e 0,84). O crescimento foi alométrico negativo (menor crescimento de CC em relação à LC) para ambos os sexos. A maior frequência de fêmeas ovígeras (78%) e no estágio IV de maturação (38%) pertenciam à classe de tamanho de LC 59,8 - 67,5 mm. O maior pico de fêmeas maduras ocorreu nos meses de maio e agosto, mostrando um período reprodutivo diferente de outros estados do Brasil.
ABSTRACT
Identificar os fatores bióticos e abióticos que determinam a variação na distribuição e abundância das populações, tornou-se nos últimos anos um grande desafio para os ecologistas. Assim neste estudo foram avaliados o efeito das variáveis abióticas e a abundância de predadores sobre a abundância de Moenkhausia sanctaefilomenae, a variação no comprimento médio dos indivíduos entre lagoas e períodos e o efeito das variáveis abióticas e da abundância de predadores sobre a estrutura em comprimento. Foram amostradas 16 lagoas da planície de inundação do rio Cuiabá, no período de junho (vazante), setembro (seca) e dezembro (enchente) de 2005 e março (cheia) de 2006. Para M. sanctaefilomenae, a distribuição é mais ampla e a abundância é maior no final da vazante, início da seca, reduzindo-se gradualmente ao longo dos períodos de seca, enchente e cheia. Adicionalmente, o período afeta a estrutura em tamanho das populações, que são espacialmente homogêneas. Indivíduos menores foram capturados no final do período de vazante e os maiores ao início da enchente. Durante o final da vazante/início da seca, a variação espacial na abundância da população foi relacionada positivamente com o pH, o oxigênio dissolvido e cobertura de macrófitas e área da lagoa, mas, não com a abundância local de predadores na zona litorânea das lagoas.
Identifying the biotic and abiotic factors that determine the variation in the distribution and abundance of populations has become a great challenge for the field of ecology in recent years. Thus, in this study we evaluated the effect of abiotic variables and the abundance of predators on the abundance of Moenkhausia sanctaefilomenae, the variation in the average length of the individuals between lakes and periods, and the effect of the abiotic variables and abundance of predators on the structure in length of that species. Sixteen lakes of the Cuiabá river flood plain were sampled in June (drying period), September (dry period) and December (flooding period) 2005 and March (flood period) 2006. For M. sanctaefilomenae, the distribution is ampler and the abundance is greater at the end of the drying period, beginning of dry season, reducing gradually over the periods of dry, drying and flood season. Additionally, the period affects the structure in size of the populations that are spatially homogeneous. Smaller individuals were captured at the end of the drying period and the larger individuals at the start of flooding. During the end of the drying period and in the beginning of the dry season, the spatial variation in the abundance of the population was positively related with pH, dissolved oxygen and macrophyte cover and area of the lake, but not with the local abundance of predators in the littoral zone of the lakes.
Subject(s)
Animals , Population , Abiotic Factors , Biotic Factors , EcologyABSTRACT
O presente estudo compara a composição e estrutura das comunidades de palmeiras da Área de Proteção Ambiental Raimundo Irineu Serra - APARIS, localizada no perímetro urbano do Município de Rio Branco-Acre. Foram selecionadas três áreas de floresta secundária em estágios sucessionais distintos: 7,5 anos, 27,5 anos, 37,5 anos de idade, e um fragmento de floresta primária. Em cada área foram instaladas cinco parcelas de 20 X 20m, onde foram analisadas a composição florística, estrutura horizontal e estrutura populacional das palmeiras. Foram identificados 1.034 indivíduos, incluídos em 12 gêneros e 19 espécies de palmeiras. A área de floresta primária apresentou maior diversidade. Na análise da estrutura populacional de cada área, comprovamos a existência de uma escassez de plântulas (≤ 50 cm de altura) e adultos reprodutivos. A fragmentação alterou a composição e diminuiu a riqueza e a diversidade de palmeiras na área da APARIS, enquanto, está favorecendo a dominância de certas espécies como A. phalerata.
This study compares the composition and structure of palm communities in fragments of secondary and primary forest within the Raimundo Irineu Serra Environmental Protection Area (APARIS), located at the urban perimeter of Rio Branco, Acre. To evaluate the palm communities, we selected secondary forest areas belonging to three distinct successional stages: 7.5 years; 27.5 years, 37.5 years, and a primary forest fragment. In each forest type we installed five 20 x 20 m plots, where we analyzed floristic composition, vegetation structure, and population demography of all palm species (Arecaceae). In all, we identified 1034 palm individuals, including 12 genera, 19 species. Primary forest exhibited the greatest palm diversity. Structural analysis of each area revealed a scarcity of seedlings (≤ 50 cm tall) and reproductive adults. Fragmentation altered the composition and decreased the richness and diversity of palms within the APARIS, while at the same time, favoring the dominance of certain species, such as A. phalerata.
Subject(s)
Forests , Arecaceae , FlowersABSTRACT
Streams contain an expressive fraction of the South American fish diversity, mostly composed of small-sized, endemic, and rare species. Populational, reproductive, and diet aspects of Microglanis garavelloi were studied, aiming to make a wide characterization of this species of bumblebee catfish. This is an endemic species of the Upper Paraná River Basin, and the only representative of the genus in the watershed. It is a littoral-dweller of small rivers, with asymptotic length of 34.1 mm and a population mostly composed of individuals with 20-30 mm of standard length. This species presents high fecundity and mortality rate, and low longevity and growth rate. It is a total spawner, October to February being the spawning period, and probably has brood care behavior, as has been already observed for some Heptapteridae species. The species can be considered an active predator, probably presenting benthic life like most siluriforms, having a diet uniquely composed of aquatic insect larvae. This species occurs as small populations patchily distributed in the Upper Paraná River Basin. This population characteristic, combined with the progressive environmental degradation of its habitats, points to a situation of constant threat that could lead to an irreversible extinction process.
Rios de pequeno porte abrigam uma importante fração da diversidade ictiofaunística sul-americana, caracterizada principalmente por espécies endêmicas, raras e de pequeno porte. Com o objetivo de realizar uma ampla caracterização da espécie Microglanis garavelloi, encontrada em pequenos corpos d'água da Bacia do Alto Rio Paraná, foram estudados alguns de seus aspectos populacionais, reprodutivos e alimentares. Essa espécie é endêmica do Alto Rio Paraná, sendo a única representante do gênero nessa bacia. Ela ocupa principalmente a região litorânea de pequenos rios, apresenta comprimento assintótico de 34,1 mm, e população composta principalmente por indivíduos com comprimento padrão entre 20 e 30 mm. Esta espécie apresenta alta fecundidade, alta taxa de mortalidade, baixa longevidade e baixa taxa de crescimento. Além disso, apresenta desova total, que ocorre de outubro a fevereiro e, provavelmente, apresenta comportamento de cuidado com a prole, como já observado em algumas espécies de Heptapteridae. Sua dieta é baseada unicamente em larvas de insetos aquáticos, podendo ser considerada uma predadora com comportamento alimentar ativo e, provavelmente, apresenta vida bentônica, como a maioria dos Siluriformes. Esta espécie ocorre como populações pequenas com distribuição fragmentada na bacia do Alto Rio Paraná. Esta característica populacional, acrescida da constante degradação ambiental em seus hábitats, indica uma situação de constante ameaça que pode levar a um irreversível processo de extinção.
ABSTRACT
Variação do peso fresco em Cornops aquaticum (Bruner) (Orthoptera, Acrididae) associado a Eichhornia azurea (Sw) Kunth (Pontederiaceae) em uma baía no Pantanal de Poconé, Mato Grosso. Cornops aquaticum (Bruner, 1906) (Orthoptera, Acrididae) desenvolve seu ciclo de vida sobre macrófitas aquáticas da família Pontederiaceae. Como os gafanhotos são capazes de responder às mudanças sazonais, a alternância de períodos que ocorre no Pantanal pode refletir em sua biologia. Este estudo foi desenvolvido no Pantanal de Poconé - MT, com o objetivo de avaliar possíveis variações no peso fresco dos adultos e ninfas de C. aquaticum. Durante o período de março/2006 a fevereiro/2007 coletaram-se mensalmente, 50 indivíduos de C. aquaticum. Um total de 600 indivíduos foi avaliado, sendo 43,5 por cento adultos e 56,5 por cento ninfas. Os maiores valores de peso fresco total ocorreram nos meses de setembro (9,106g; 0,182g/indivíduo) e outubro/2006 (8,865g; 0,177g/indivíduo) e os menores em março/2006 (3,413g; 0,068g/indivíduo). Nos indivíduos adultos os maiores pesos frescos foram registrados em setembro/2006 (8,680g; 0,223g/indivíduo) e outubro/2006 (8,654g; 0,234g/indivíduo), no final do período de seca, e o menor em março/2006 (1,792g; 0,138g/indivíduo), durante o período de cheia. As ninfas tiveram o maior peso fresco em abril/2006 (2,913g; 0,076g/indivíduo) início da vazante, enquanto o menor peso fresco ocorreu em outubro/2006 (0,211g; 0,016g/indivíduo) início da enchente. Apenas a variação no peso fresco médio das fêmeas foi significativa (f = 6,43; p = 0,001), com os maiores registros durante o período de enchente, o que pode evidenciar uma estratégia reprodutiva.
Cornops aquaticum (Bruner, 1906) (Orthoptera, Acrididae) develops its life cycle on aquatic macrophyte of the Pontederiaceae family. As grasshoppers are able to respond to the seasonal changes, the alternation of periods that occurs in the Pantanal may reflect in their biology. This study was carried out in the Pantanal of Poconé- MT, with the aim of evaluating possible variations in the fresh weight of the adults and nymphs of C. aquaticum. From March/2006 to February/2007, 50 individuals of C. aquaticum were collected each month. A total of 600 individuals was assessed, 43.5 percent of which were adults and 56.5 percent nymphs. The highest values of total fresh weight occurred in September (9.106g; 0.182g/individual) and October/2006 (8.865g; 0.177g/individual) and the lowest in March/2006 (3.413g; 0.068g/individual). Among the adult individuals the highest fresh weight was registered in September/2006 (8.680g; 0.223g/individual) and October/2006 (8.654g; 0.234g/individual), at the end of the dry period, and the lowest in March/2006 (1.792g; 0.138g/individual) during the flood period. The nymphs had the highest fresh weight in April/2006 (2.913g; 0.076g/individual) at the beginning of the draining period, whereas the lowest fresh weight occurred in October/2006 (0.211g; 0.016g/individual) at the beginning of the flood period. Only the variation in the average fresh weight of females was significant (f = 6.43; p = 0.001) with the highest recordings occurring during the flood period, what may show a reproductive strategy.
ABSTRACT
O objetivo desse trabalho foi caracterizar a população de Corydoras flaveolus do Rio Passa Cinco com relação à estrutura em comprimento, proporção sexual e aspectos reprodutivos de acordo com os períodos de seca e cheia, bem como analisar sua condição corporal. Seis amostragens foram realizadas em cinco pontos distintos no Rio Passa Cinco (contemplando trechos de ordem dois, três, quatro, cinco e seis) com o uso de peneira, pesca elétrica e covos. Foram capturados 70 indivíduos, sendo 35 machos e 35 fêmeas. Não houve variação significativa nos graus de repleção e de gordura acumulada na cavidade visceral dos exemplares analisados entre os períodos considerados. O período reprodutivo de C. flaveolus foi extenso, sendo mais intenso na cheia, visto a maior porcentagem de indivíduos com gônadas maduras e o maior valor da relação gonadossomática durante esse período. A fecundidade absoluta média foi de 137 ovócitos, sendo a desova do tipo intermitente. As fêmeas foram maiores e relativamente mais pesadas do que os machos. Não houve diferença significativa na condição corporal de ambos os sexos entre os períodos considerados.
The aim of this work was to characterize the population of Corydoras flaveolus in Passa Cinco stream, regarding length structure, sex ratio and reproductive aspects, in accordance with drought and rainy season periods, as well as to analyze its corporal condition. Six samplings were accomplished in five different points of Passa Cinco stream (contemplating sites of orders two to six) through use of a sieve, electric fishery equipment and fish-traps. It was captured 70 individuals, composed by 35 males and 35 females. There was not significant variation in repletion degree and accumulated fat in visceral cavity of the individuals analyzed during the considered periods. The reproductive period of C. flaveolus was extensive and more intense in the rainy season due to the largest percentage of individuals with mature gonads and higher value of gonadossomatic relationship founded in that period. The average of absolute fecundity was of 137 oocytes, and the intermittent type of spawning was performed. The females were larger and heavier than males in the same lenght. There was no difference in corporal condition of both sexes between the periods considered.
ABSTRACT
Solanum mauritianum Scopoli (Solanaceae), a native Brazilian shrub, has become naturalized and invasive in several countries. In South Africa, where invasions are severe, herbivorous insects that attack S. mauritianum in its native area have been considered for introduction as biological control agents. To assess the action of such herbivores on the plant, studies were carried out on a population of S. mauritianum in an area undergoing regeneration in southern Brazil. An analysis of the structure of that population was performed, as well as of herbivory by insects, in particular of Anthonomus (Curculionidae). The population structure showed an "inverted J" pattern in diameter classes, but not in height classes. Individual plants showed an aggregate distribution. The damage caused by Anthonomus did not amount to the loss of a large leaf area, but since it was inflicted on young leaves and in a large proportion, could lead to the survival decrease.
Solanum mauritianum Scopoli (Solanaceae), um arbusto endêmico do sul do Brasil, naturalizou-se e tornou-se invasor em vários países do mundo. Na África do Sul, onde as invasões são severas, insetos fitófagos associados à planta no país de origem têm sido considerados para introdução como agentes de controle biológico. Para avaliar a ação de tais insetos no ambiente natural, foram conduzidos estudos em uma população de S. mauritianum em uma área em regeneração no sul do Brasil. Foi realizada análise da estrutura populacional, bem como da herbivoria causada por insetos, em particular para uma espécie do gênero Anthonomus (Curculionidae), para subsidiar o trabalho sobre controle biológico. A estrutura da população mostrou um padrão "J invertido" nas classes de diâmetro, mas não nas classes de altura; a distribuição espacial dos indivíduos era agregada. O dano causado por Anthonomus sp. não refletiu na perda real de grande área foliar. No entanto, uma vez que foi detectada uma grande freqüência de danos sobre indivíduos jovens, a herbivoria poderia levar à diminuição da sobrevivência da planta.
ABSTRACT
O objetivo do trabalho foi analisar a taxocenose de bagres marinhos do complexo baía-estuário de São Vicente, SP. As coletas foram mensais, no período de setembro de 2000 a agosto de 2002, em quatro regiões do estuário. Foram capturados 3.985 exemplares, pertencentes a cinco gêneros e seis espécies, totalizando 47.807 g. A espécie Cathorops spixii apresentou a maior abundância numérica com 1.569 indivíduos amostrados. No transecto I (próximo da região costeira) foi registrada a maior riqueza e no transecto IV (estuário acima) a maior abundância com 2.602 exemplares e peso de 26.236 g. Em março de 2002 registrou-se a maior abundância com 687 indivíduos e o maior peso ocorreu em fevereiro de 2002 (8.816 g). A salinidade da água de fundo, ao longo do período de estudo, variou entre 14 e 36 e a temperatura da água variou entre 19 e 30 ºC. Na região amostrada foram capturados exemplares jovens e adultos, ocorrendo um predomínio de jovens, o que demonstra que esta área apresenta condições favoráveis para crescimento.
The purpose of this study was to analyze the taxocenose of marine catfish in the complex bay-estuary of Sao Vicente, Brazil. The sampling was done monthly from September/2000 to August/2002, in four places of the estuary. Were caught 3.985 individuals belonging for 5 genus and 6 species, totalizing 47.807 g. The specie Cathorops spixii showed the biggest plentiful with 1.569 individuals sampled. In the transect I (close to the coastal region), it was registered the biggest richness (6 species) and in the transect IV (upper estuary) the biggest number of individuals (n = 2.602) e weight of 26.236 g. In March/2002 were registered the biggest occurrence with 687 individuals and biggest weight in February/2002 (8.816 g). The bottom water salinity, in the time of study, changed between 14 and 36, and the water temperature varied between 19 and 30 ºC. In the sample place juveniles and adults' individuals were caught, a mostly juvenile which demonstrates that of this place shows favorable conditions for growth.
Subject(s)
Behavior , Biodiversity , Ecosystem/analysis , Ecosystem/classification , Ecosystem/adverse effects , Marine Fauna , Fishes/growth & developmentABSTRACT
The Pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) is one of the most endangered Neotropical cervid with populations that have been drastically reduced to small and isolated ones, mainly because of its habitat destruction. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to analyze population divergence and genetic variation within and between two populations corresponding to distinct subspecies. The RAPD markers displayed substantial genetic variation with all animals possessing unique RAPD phenotypes over 105 polymorphic bands produced by 15 primers. An analysis of molecular variance (AMOVA) and a neighbor-joining cluster analysis were performed to assess levels of differentiation between populations. No differentiation was recorded and about 96.0 percent (P < 0.00001) of the total variance was attributable to variation within populations. This result is quite distinct from data obtained by the analysis of the mtDNA control region, and is discussed on the basis of genetic differences between the different markers and the male-biased dispersal patterns generally observed in the mammal species. The data presented herein are potentially useful for future taxonomic and genetic studies in this species, for the monitoring of the genetic variation observed within these populations, and for the development of management guidelines for its conservation.
O Veado-campeiro (Ozotoceros bezoarticus) é uma das espécies de cervídeos neotropical mais ameaçadas devido à destruição de seu hábitat e conseqüente redução e isolamento de suas populações. Marcadores do tipo RAPD (Random amplified polymorphic DNA) foram utilizados na análise da divergência populacional e estimativa da variação genética dentro e entre duas populações correspondentes a diferentes subespécies. Os marcadores RAPD mostraram uma variação genética substancial, sendo que as 105 bandas polimórficas obtidas pelo uso de 15 primers produziram fenótipos únicos para todos os indivíduos analisados. Para avaliar o nível de diferenciação entre as populações, foi realizada uma análise da variância molecular (AMOVA) e uma análise de agrupamento utilizando o método de neighbor-joining. Nenhuma diferenciação foi observada, sendo aproximadamente 96,0 por cento da variação encontrada atribuída à variação dentro das populações estudadas. Este resultado difere do obtido através da análise da região controle do mtDNA, e é discutido levando-se em consideração as diferenças genéticas entre os diferentes marcadores utilizados e o padrão de dispersão geralmente observado nas espécies de mamíferos (realizada principalmente pelos machos). Os dados aqui apresentados poderão ser úteis para futuros estudos taxonômicos e genéticos desta espécie, para o monitoramento da variação genética observada em suas populações e para o desenvolvimento de estratégias de manejo para sua conservação.
Subject(s)
Animals , Deer/genetics , Genetic Variation , Brazil , DNA, Mitochondrial/genetics , Random Amplified Polymorphic DNA TechniqueABSTRACT
The Pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) is one of the most endangered Neotropical cervid with populations that have been drastically reduced to small and isolated ones, mainly because of its habitat destruction. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to analyze population divergence and genetic variation within and between two populations corresponding to distinct subspecies. The RAPD markers displayed substantial genetic variation with all animals possessing unique RAPD phenotypes over 105 polymorphic bands produced by 15 primers. An analysis of molecular variance (AMOVA) and a neighbor-joining cluster analysis were performed to assess levels of differentiation between populations. No differentiation was recorded and about 96.0% (P 0.00001) of the total variance was attributable to variation within populations. This result is quite distinct from data obtained by the analysis of the mtDNA control region, and is discussed on the basis of genetic differences between the different markers and the male-biased dispersal patterns generally observed in the mammal species. The data presented herein are potentially useful for future taxonomic and genetic studies in this species, for the monitoring of the genetic variation observed within these populations, and for the development of management guidelines for its conservation.
O Veado-campeiro (Ozotoceros bezoarticus) é uma das espécies de cervídeos neotropical mais ameaçadas devido à destruição de seu hábitat e conseqüente redução e isolamento de suas populações. Marcadores do tipo RAPD (Random amplified polymorphic DNA) foram utilizados na análise da divergência populacional e estimativa da variação genética dentro e entre duas populações correspondentes a diferentes subespécies. Os marcadores RAPD mostraram uma variação genética substancial, sendo que as 105 bandas polimórficas obtidas pelo uso de 15 primers produziram fenótipos únicos para todos os indivíduos analisados. Para avaliar o nível de diferenciação entre as populações, foi realizada uma análise da variância molecular (AMOVA) e uma análise de agrupamento utilizando o método de neighbor-joining. Nenhuma diferenciação foi observada, sendo aproximadamente 96,0% da variação encontrada atribuída à variação dentro das populações estudadas. Este resultado difere do obtido através da análise da região controle do mtDNA, e é discutido levando-se em consideração as diferenças genéticas entre os diferentes marcadores utilizados e o padrão de dispersão geralmente observado nas espécies de mamíferos (realizada principalmente pelos machos). Os dados aqui apresentados poderão ser úteis para futuros estudos taxonômicos e genéticos desta espécie, para o monitoramento da variação genética observada em suas populações e para o desenvolvimento de estratégias de manejo para sua conservação.